Using pharmacophore query builder

 
01. 전체 창의 구성 및 주요 기능 02. Pharmacophore Query 그리기 03. Feature 지우기
 
01. 전체 창의 구성 및 주요 기능

1) 버튼 기능
Donor : Hydrogen Bond Donor의 성질을 설정할 때 사용합니다.
Acceptor : Hydrogen Bond Acceptor의 성질을 설정할 때 사용합니다.
Aromatic : Aromatic 성질을 설정할 때 사용합니다.
Aliphatic : Aliphatic 성질을 설정할 때 사용합니다.
2) 검색 관련 버튼
Open : mol file 형태의 3D 분자구조를 열 때 사용합니다.
Search : 검색을 시작할 때 사용합니다.
Reset : 3D filter를처음으로 되돌릴 때 사용합니다.
 
02. Pharmacophore Query 그리기
1) Upload 3D structure (MDL mol file format)
  MDL mol file 형식의 3D 분자구조를 불러옵니다.

2) Select features
  분자에서 화학성질을 설정합니다. 이때 화학성질은 3 개 이상을 입력해야 합니다.


< 화학성질 설정법 >
먼저 분자의 원자를 선택하고, 4개의 화학성질 중 설정하고자 하는 화학성질의 버튼을 누르시면 됩니다.
원자 선택 시 선택된 원자의 색이 노란색으로 바뀝니다.

 
< 화학성질 다중 선택 >
화학성질은 다중 선택이 가능합니다. 여러 개의 원자에 같은 화학성질을 설정하고자 할 때는 화학성질을 설정할 원자들을 선택합니다. 그런 다음  설정할 화학성질의 버튼을 누릅니다. 선택한 원자를 한 번 더 클릭하면 선택이 해제됩니다.

  •   Donor, Acceptor는 한 원자에 하나의 화학성질이 표시됩니다.
  •   Aromatic, Aliphatic의 경우 선택된 원자들의 중심에 각 성질이 나타납니다.
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    03. Feature 지우기
      Pharmacophore query를 그리는 중에 그렸던 화학성질을 취소하려면, 먼저 지우고자 하는 화학성질을 선택한 후 "Delete key"를 누르면 됩니다.