About ChemDB

01. 제공되는 데이터베이스 02. 제공 정보 03. 검색 기능
04. 구조 검색 후 필터 기능 05. 국외 DB와의 직접적인 연결을 통한 부가적인 화합물 정보 제공
신약설계를 위한 화합물 데이터베이스 ChemDB는 KISTI(한국과학기술정보연구원 http://www.kisti.re.kr)에서 주관한 첨단지식정보구축 사업인 지식정보연계활용체제구축 사업을 시작으로 하여 2000년부터 2005년까지 BMD(사단법인 분자설계연구소 http://www.bmdrc.org)의 기술 지원을 통해 구축된 화학 및 의약, 생물 분야에서 활용될 수 있는 전문 데이터베이스 검색 시스템입니다.

본 검색시스템은 현재 유료화 시범사업으로 지정되어 진행되고 있으며, 등록 후 사용할 수 있습니다. 일부 데이터베이스와 검색 결과를 sd 파일로 다운로드 받는 것은 유료로 운영되고 있습니다.
  무료 - NCI database, Drug database, PhysChem database
  유료 - Building Blocks database, Available Chemicals database, sd 파일 download
회원 등록은 홈페이지 상단에 My page 메뉴에서 할 수 있습니다.
01. 제공되는 데이터베이스
1) NCI (National Cancer Institute) 데이터베이스
  NCI에서 제공하는 AIDS 및 Cancer HTS (High Throughput Screening) 데이터 제공
  약 250,000 개 화합물의 2차원 분자구조 포함
2) Drug 데이터베이스
  USAN의 USP Dictionary에 포함된 drug에 대한 classification 정보 등 제공
  약 2,500 개 drug의 2차원 분자구조 포함
3) PhysChem 데이터베이스
  SRC의 PHYSPROP 데이터와 각 종 시약 catalog의 데이터 제공
  약 41,000 개 화합물의 2차원 분자구조 포함
4) Available Chemicals 데이터베이스
  여러 시약 회사에서 구매 가능한 화합물들에 대한 정보 제공
  약 150만 개의 화합물에 대한 2차원 분자구조 포함
5) Building Blocks 데이터베이스
  여러 시약회사에서 구매 가능한 building block에 대한 정보 제공
  약 250,000 개 building block의 2차원 분자구조 포함
02. 제공 정보
1) 2차원 화학구조에 대한 정보
  화합물의 일반 정보
   Common name, IUPAC name, 화학식, 분자량
  물리화학적 실험값
   Melting point, Boiling point, Density, logP, Refractivity, Water Solubility
  계산된 물리화학적 물성값
   Melting point, Boiling point, logD7.4, Water Solubility, Refractivity, Solvation free energy, 
Polarizability by CDEAP method, Vapor Pressure, pKa value by Pallas program
  계산된 구조적 표현자
   No. H-bond acceptors, No, H-bond donors, No. aromatic rings, No. rings,
No. rotatable bonds
  계산된 위상적, 기하학적 표현자
   Balaban index (JX, JY), Chi 0-3, vChi 0-3, Flexibility index, Wiener index, Kappa shape 1-3, Kappa alpha 1-3, Topological polar surface area
  PreADME에서 계산된 Drug-likeness 적합도
   Lipinski's rule, Lead-like rules, Drug DB like rules (CMC, MDDR), No. reactive functional groups
  PreADME에서 계산된 ADME 예측값
   BBB (Blood-Brain Barrier Penetration value), HIA (Human Intestinal Absorption value)
2) 3차원 구조에 대한 정보
  계산된 3차원 기하학적 표현자
   van der Waals surface, van der Waals volume, solvent accessible surface, solvent accessible volume, principal moments of inertia
  양자화학적 표현자
   Dipole moment and its components, HOMO and LUMO energy
03. 검색 기능
  일반정보 검색
   항목: Name, CAS-RN, Formula
  구조 검색
   2차원 구조 동일성 검색
 2차원 구조 Substructure 검색
 2차원 구조 유사성 검색
 Pharmacophore 검색
04. 구조 검색 후 필터 기능
  Drug-likeness 적합도를 이용한 filter
   Lipinski's rule에 의한 filter
 Lead-like rule에 의한 filter
 MDDR(또는 CMC) drug DB와 유사한 물성을 지닌 화합물을 검색 결과로 얻도록 filter
 체내에서 반응으로 독성을 유발하는 reactive functional group을 지닌 구조 filter
  체내 장투과와 뇌혈관투과도 및 물용해도를 이용한 filter
   BBB (Blood-Brain Barrier Penetration, Cbrain/Cblood)
 HIA (Human Intestinal Absorption, %)
 Water Solubility (mg/L)
05. 국외 DB와의 직접적인 연결을 통한 부가적인 화합물 정보 제공
 
Structural Information
Spectroscopy
Biological Activity Information
Drug Information
Reference of Chemicals
Toxicity and Risk Assessment
Toxnet (Toxicology Data Network)
Environmental Information
Substance Registry Information