About NCI database

NCI database는 미국 NCI (the National Cancer Institute)의 the Developmental Therapeutics Program Division of Cancer Treatment에서 구축한 공개 data를 제공하는 database입니다. 본 데이터베이스에서는 약 250,000 개 이상의 2차원 분자구조와 각각의 2차원 분자구조에 대한 3차원 구조들, AIDS antiviral screening data (Oct 1999 release) 및 Human tumor cell line screening data (Aug 1999 release)를 제공하고 있습니다. 

제공되는 AIDS antiviral screening data는 아래와 같습니다.

  • EC50 : the concentrations necessary to see a protective effect on the infected cells

  • IC50 : the concentrations necessary to inhibit the growth of uninfected cells

  • screen conclusion : the result of the screening tests. 결과는 다음과 같이 세 가지 카테고리로 나누어 나타내고 있습니다.
    - CA : Confirmed active
    - CM : Confirmed moderately active
    - CI : Confirmed inactive


제공되는 Human tumor cell line screening data는 아래와 같습니다.

  • logGI50 (GI50 : the growth inhibitory power of the test agent)

  • logLC50  (LC50 : a cytotoxic effect))

  • logTGI  (TGI : a cytostatic effect)

NCI database에서는 Name, CAS 번호, 화학식으로 텍스트 검색을 할 수 있으며, 여러 가지 분자구조 검색(exact, substructure, similarity search)을 할 수 있습니다. 또한 pharmacophore  검색을 통해 database의 3차원 구조를 검색할 수 있습니다.